Būtent tada iš dviejų Kauno komandų sudaryta ekipa buvo perkelta į Vilnių ir pavadinta „Dinamo“. Po metų ji buvo pervadinta „Spartaku“, o 1962-aisiais gavo „Žalgirio“ vardą.
Futbolo klubas „Žalgiris“ garsino Vilnių iki 2008-ųjų, kai šią organizaciją ištiko finansinė krizė. Gelbėdami legendinę komandą nuo išnykimo, ištikimiausi ekipos gerbėjai iš „Pietų IV“ tribūnos 2009 metų vasario 26 dieną įkūrė Vilniaus miesto futbolo draugiją (VMFD) „Žalgiris“.
Dėl teisinių aplinkybių naujoji organizacija turėjo atsiriboti nuo futbolo klubo „Žalgiris“ istorijos ir savąją skaičiuoti tik nuo 2009-ųjų. Šiandien padėtis pasikeitė - VMFD „Žalgiris“ oficialiai tapo legendinės komandos istorijos tęsėja ir nuo kito sezono vadinsis futbolo klubu „Žalgiris“.
„Ši diena yra labai svarbi mums visiems - „Žalgirio“ vadovams, treneriams, žaidėjams, aistruoliams. Vilniuje visada buvo tik vienas „Žalgiris“, todėl šiandien didžiuodamiesi galime pareikšti, kad visi kartu tęsiame tradicijas, istoriją, kuri pradėta rašyti dar 1947-aisiais. Tai dabar atsispindi ir mūsų logotipe“, - džiaugėsi „Žalgirio“ vykdomoji direktorė Vilma Venslovaitienė.
„Savivaldybė ieško vietos, kurioje būtų galima visuomenei pristatyti „Žalgirio“ iškovotų trofėjų muziejų. Tai įvyks kitais metais, sezono atidarymui“, – antrino Vilniaus miesto meras, „Žalgirio“ garbės prezidentas Artūras Zuokas.
Vilniaus „Žalgiris“ per savo istoriją jau 5 kartus tapo Lietuvos čempionu (1991, 1992, 1999, 2013, 2014), 8 kartus iškovojo LFF taurę (1991, 1993, 1994, 1997, 2003, 2012, 2013, 2014) ir 4 kartus - Supertaurę (2003, 2012, 2013, 2014). Be to, 1987 metais vilniečiai iškovojo SSRS čempionato bronzos medalius, o 1987-aisiais, atstovaudami SSRS rinktinei, laimėjo Universiadą.
„Žalgirio“ auklėtiniai iškovojo ne vieną titulą atstovaudami rinktinėms ar kitiems klubams. Arminas Narbekovas ir Arvydas Janonis tapo 1988-ųjų olimpiniais čempionais, Viačeslavas Sukristovas - 1988-ųjų Europos vicečempionu, Edgaras Jankauskas - Čempionų lygos ir UEFA taurės laimėtoju, pastarąją taurę virš galvos kėlė ir Deividas Šemberas.
