Ministrų kabineto nutarime pažymima, jog transseksualumas yra lyties tapatumo sutrikimas, todėl draudimas keisti lytį prilygtų draudimui teikti psichikos sveikatos paslaugas, o tai prieštarautų Lietuvos įstatymams ir tarptautiniams įsipareigojimams.
Lietuvos Civilinis kodeksas dabar įtvirtina, kad nesusituokęs pilnametis asmuo turi teisę medicininiu būdu pakeisti savo lytį, jeigu tai mediciniškai įmanoma. Tačiau ši nuostata realiai neveikia, nes nėra priimta specialaus įstatymo. Lietuva dėl tokios situacijos yra pralaimėjusi bylą Europos Žmogaus Teisių Teisme.
Seimas gegužę po pateikimo pritarė Seimo narių Antano Matulo, Vidos Marijos Čigriejienės ir Arimanto Dumčiaus Civilinio kodekso pataisos projektui, kad "medicininis lyties pakeitimas Lietuvoje draudžiamas". Pataisos perduotos svarstyti parlamento komitetams.