2004-2006 m. Lietuvai buvo skirta beveik 3 091 mln. litų ES struktūrinės paramos, iš kurios 2 198 mln. litų šiandien jau įsisavinta, t.y., paramos lėšos išmokėtos projektų vykdytojams ir rangovams (paslaugų teikėjams ir prekių tiekėjams) bei pripažintos tinkamos deklaruoti Europos Komisijai. Tai sudaro 71 proc. Europos Sąjungos struktūrinių fondų lėšų, naudojamų pagal 2004-2006 m. bendrąjį programavimo dokumentą (BPD).
Vidutiniai ES struktūrinės paramos įsisavinimo tempai pagal BPD nuolat didėjo: 2004 m. buvo įsisavinama 5,5 mln. litų per mėnesį, 2005 m. – 21 mln. litų per mėnesį, 2006 m. – 53,4 mln. litų per mėnesį, o 2007 m. – 81 mln. litų per mėnesį. Per šių metų kovą įsisavinta 106 mln. litų ES lėšų (3,4 proc. BPD ES lėšų) – tai didžiausia įsisavinta ES lėšų suma šiais metais.
Jau yra baigti įgyvendinti 2266 projektai, o 1264 projektai dar įgyvendinami. Iš viso per 2004-2006 m. ES struktūrinės paramos laikotarpį finansuojama daugiau nei 3500 projektų.
Iki 2008 m. kovo 31 d. ES lėšų panaudojimo planai iš esmės vykdomi pagal visus ES struktūrinius fondus. Europos Socialinio fondo, Europos Žemės ūkio orientavimo ir garantijų fondo ir Žuvininkystės orientavimo finansinės priemonės atvejais - netgi su perviršiumi.
Sparčiausiai ES struktūrinių fondų lėšos įsisavinamos pagal BPD priemones, finansuojamas Žuvininkystės orientavimo finansinės priemonės lėšų (jau įsisavinta – 85 proc.) ir Europos žemės ūkio orientavimo ir garantijų fondo (jau įsisavinta – 84 proc.) lėšų. Pagal Europos regioninės plėtros fondo lėšomis finansuojamus projektus įsisavinta 67 proc. ES lėšų, o Europos socialinio fondo – 64 proc. (pažymėtina, kad pastaruoju metu šio fondo lėšų įsisavinimas ženkliai paspartėjo).
ES struktūrinės paramos lėšos intensyviausiai naudoti bus pradėtos antrąjį šių metų pusmetį. Pats projektų įgyvendinimas neretai priklauso nuo sezono, tad šiuo metu dauguma projektų pradedami įgyvendinti sparčiau. Kita vertus, nuo 2004 m. patobulėjo ES struktūrinės paramos valdymo ir administravimo sistema, taip pat pagerėjo projektų vykdytojų kompetencija – dabar jie turi daugiau žinių, patirties, reikalingų įgūdžių. Taigi, ir ES lėšų įsisavinimo sparta atitinkamai didėja.
Sanglaudos fondo parama 2000–2006 m. Lietuvoje buvo suteikta 53 transporto ir aplinkos apsaugos infrastruktūros atnaujinimo projektams įgyvendinti, jiems skirta paramos suma – beveik 2 852 mln. litų. Vyriausybė pritarė Sanglaudos fondo lėšų įsisavinimo planams iki 2010 metų, vykdoma nuolatinė jų įgyvendinimo kontrolė. Įvertinus ankstesnių metų lėšų įsisavinimo augimo dinamiką bei vykdant patvirtintus planus, projektus numatoma įgyvendinti iki nustatyto termino.
Pagrindinė problema, atsiradusi įgyvendinant Sanglaudos fondo projektus – papildomų lėšų poreikis. Šiai problemai spręsti finansų ministro įsakymu sudaryta darbo grupė, kurioje narių teisėmis dalyvauja Lietuvos Respublikos Vyriausybės, Finansų ir Aplinkos ministerijų, Aplinkos projektų valdymo agentūros bei savivaldybių asociacijos atstovai, o aptariant atskirus projektus - ir specialistai iš savivaldybių ir/arba jų įmonių. Darbo grupės susitikimų metu ieškoma įvairių problemos sprendimo būdų.
