Po vienerių metų pertraukos Paulius Jankūnas grįžta į Kauno „Žalgirį“. Su 26-erių metų 205 cm ūgio puolėju klubas pasirašė kontraktą pagal formulę 2+1.
P.Jankūnas „Žalgirio“ pagrindinėje komandoje žaidė nuo 2003-ųjų iki 2009-ųjų, o praėjusį sezoną atstovavo Maskvos srities „Chimki“ klubui. Šioje Rusijos ekipoje puolėjas Eurolygos rungtynėse vidutiniškai žaisdavo po 25 minutes, rinkdavo po 8,2 taško ir atkovodavo po 4,9 kamuolio. Tuo tarpu 2008/2009 m. sezone atstovaujant Kauno „Žalgiriui“ stipriausios Europos lygos rungtynėse krepšininko statistika buvo dar įspūdingesnė - 13,8 taško ir 8 atkovoti kamuoliai per 31 žaidimo minutę.
Septintąjį sezoną Kauno „Žalgiryje“ netrukus pradėsiantis Paulius Jankūnas šiuo metu aktyviai dirba su Lietuvos rinktine treniruočių stovykloje Palangoje. Kartu su juo treniruojasi ir kiti žalgiriečiai – Tadas Klimavičius, Martynas Pocius ir Mantas Kalnietis.