2012 m. išlaidų MTEP santykis su bendruoju vidaus produktu (BVP) sudarė 0,9 procento (2011 m. – 0,92 proc.). Aukštojo mokslo ir valdžios sektoriuose šis santykis buvo 0,66 procento (2011 m. – 0,68 proc.), verslo sektoriuje – 0,24 procento (2011 m. – 0,24 proc.).
2012 m. MTEP darbuotojų darbo užmokesčiui buvo skirta 497,5 mln. litų (48,5 proc. visų MTEP išlaidų), ilgalaikiam materialiajam turtui įsigyti – 286,1 mln. Lt (27,9 proc.), kitoms išlaidoms – 241,9 mln. Lt (23,6 proc.). Palyginti su 2011 m., darbo išlaidos padidėjo 35,1 mln. litų, arba 7,6 procento. Daugiausia lėšų MTEP darbuotojų darbo užmokesčiui skyrė aukštojo mokslo institucijos – 301 mln. litų, arba 54,6 procento visų aukštojo mokslo sektoriaus išlaidų MTEP. Verslo sektoriuje MTEP darbuotojų darbo užmokesčiui skirta 33,3 procento visų verslo sektoriaus išlaidų MTEP, arba 90,7 mln. litų.
Verslo sektoriuje daugiausia lėšų MTEP skyrė mokslinių tyrimų ir taikomosios veiklos (91,8 mln. Lt), informacijos ir ryšių (37,7 mln. Lt), chemikalų ir chemijos produktų gamybos (34,2 mln. Lt), kompiuterinių, elektroninių ir optinių gaminių (18,2 mln. Lt), finansinio tarpininkavimo (16,6 mln. Lt) ir žmonių sveikatos priežiūros (12,7 mln. Lt) įmonės.
Didžiausią išlaidų MTEP dalį pagal finansavimo šaltinius sudarė valstybės biudžeto lėšos – 39,9 procento, verslo įmonių lėšos – 26,1, užsienio lėšos – 33,3, aukštojo mokslo ir ne pelno institucijų lėšos – 0,7 procento.
2012 m. mokslo tiriamąja veikla užsiėmė 22,5 tūkst. darbuotojų, 7,9 tūkst. iš jų turėjo mokslo laipsnį. Sąlyginis MTEP darbuotojų skaičius siekė 10,7 tūkst. ir, palyginti su 2011 m., sumažėjo 4,5 procento. Sąlyginis tyrėjų, dalyvavusių MTEP veikloje, skaičius, palyginti su 2011 m., sumažėjo 4,4 procento (nuo 8 390 iki 8 023 asmenų).
Aukštojo mokslo ir valdžios institucijose MTEP tiek pagrindinėje, tiek nepagrindinėje darbovietėje dalyvavo 19,6 tūkst. darbuotojų, iš jų 7,7 tūkst. sudarė tyrėjai, turintys mokslo laipsnį. Vyrų tyrėjų, turinčių mokslo laipsnį, buvo 4 tūkst., moterų – 3,7 tūkst. (48,1 proc. visų tyrėjų, turinčių mokslo laipsnį), o vyresni nei 65 metų tyrėjai sudarė 9 procentus (2011 m. – 9,6 proc.) visų aukštojo mokslo ir valdžios institucijų tyrėjų, turinčių mokslo laipsnį.
Verslo sektoriuje MTEP dalyvavo 2,9 tūkst. darbuotojų, iš jų 205 tyrėjai, turintys mokslo laipsnį. Vyrų tyrėjų, turinčių mokslo laipsnį, buvo 156 (76 proc. visų tyrėjų, turinčių mokslo laipsnį), moterų – 49 (24 proc. visų tyrėjų, turinčių mokslo laipsnį). Vyresni nei 65 metų tyrėjai sudarė 1,8 procento (2011 m. – 1,4 proc.) visų verslo sektoriaus tyrėjų.
