Aplinkos ministro patvirtintame Balsio ežero pietrytinės pakrantės plačialapės klumpaitės apsaugos 2012-2014 m. veiksmų plane numatyta, kad jos augavietės apsaugai turi būti įrengta 1,8 m aukščio ir ilgesnė kaip 750 m tinklo tvora su rakinamais vartais. Raktai saugomi Pavilnių ir Verkių regioninių parkų direkcijoje ir Verkių girininkijoje.
Siekiant apsisaugoti nuo vandalų, niokojančių tvorą ir informacinius stendus, pastatytos pažeidėjus fiksuojančios kameros, kurios jų nuotraukas persiunčia darbuotojams. Pagal šias nuotraukas identifikavus pažeidėjus, jiems bus taikoma administracinė arba baudžiamoji atsakomybė.
Retųjų ir saugomų rūšių apsaugai naudoti įvairias priemones, kurios kitais tikslais gali būti draudžiamos, leidžia Saugomų gyvūnų, augalų ir grybų rūšių įstatymas. Rūšims, kurioms gresia išnykimas, apsaugoti galimas ir vandens telkinių akvatorijos aptvėrimas ar tvarkymas, miško retinimas ar kirtimas, miško kelių panaikinimas, žemėnaudos koregavimas.
