Nauja Autonominės laivų apsaugos grupės karių pamaina rengtis ES operacijai ATALANTA pradėjo nuo 2014 m. pabaigos. Šio pasirengimo metu, bendradarbiaujant su Lietuvos kariuomenės Sausumos ir Specialiųjų operacijų pajėgomis, Jungtiniu štabu ir Karo medicinos tarnyba, kariai dalyvavo į būsimos operacijos specifiką orientuotuose nacionaliniuose ir tarptautiniuose mokymuose, pratybose sausumos poligonuose ir Baltijos jūroje, pasitelkiant Karinių jūrų pajėgų laivus. Baigiamosios Autonominės laivų apsaugos grupės karių vertinimo pratybos surengtos Baltijos jūroje. Karinių jūrų pajėgų laive N42 „Jotvingis“ pamainai priskirti kariai treniravosi pagal artimą tarptautinei operacijai scenarijų ir buvo tikrinamas jų gebėjimas atremti įvairias grėsmes iš jūros, vertinama tarpusavio sąveika, vadovavimas ir vidinė organizacija.
Karių veiksmus ir pasirengimą tarptautinei operacijai vertino Karinių jūrų pajėgų kovinio rengimo specialistai, Jungtinio štabo ir Karo medicinos tarnybos atstovai. Tai bus jau trečioji Autonominės laivų apsaugos grupės pamaina, kurią ES vadovaujamai operacijai ATALANTA skiria Lietuva nuo 2013 metų. Pirmoji Autonominės laivų apsaugos grupės pamaina buvo suformuota Lietuvos didžiojo kunigaikščio Algirdo mechanizuotojo pėstininkų bataliono karių pagrindu, antroji – Karinių jūrų pajėgų karių pagrindu, dalyvaujanti operacijoje š. m. rugpjūčio-gruodžio mėnesiais.
Lietuva prie ES vadovaujamos operacijos ATALANTA prisideda nuo 2011 m., kai operacijos vadavietėje Nortvude (Jungtinėje Karalystėje) tarnybą pradėjo Lietuvos karinių jūrų pajėgų štabo karininkas. Autonominės laivo apsaugos grupės veikimo laikotarpiu dar vienas Lietuvos karinių jūrų pajėgų karininkas skiriamas tarnybai operacijos taktiniame štabe laive. Logistine parama Lietuvos kariams misijos metu teikia du Prancūzijos vadovaujamoje bazėje Džibučio Respublikos sostinėje Džibutyje dislokuoti Lietuvos kariuomenės logistikos specialistai.
Šiuo metu operacijai priskirti iš viso 20 Lietuvos karių. Viena didžiausių ES istorijoje operacijų, ATALANTA, pradėta 2008 metais, reaguojant į ypač išaugusį piratavimų skaičių prie Somalio krantų. Operacijoje dalyvaujantys karo laivai Adeno įlankoje ir Somalio vandenyse eskortuoja Pasaulio maisto programos laivus, gabenančius paramą Somalio gyventojams, atgraso ir sulaiko piratus, ginkluotus plėšikus operacijos rajone. Operacijoje dalyvauja daugiau nei 1200 karių iš ES valstybių narių ir šalių partnerių.
